دشمن شماره ی یک آرتمیس یعنی اوپال کوبویی نقشه‌ای طراحی کرده که هم آزادی‌اش از زندان تضمین شود و هم جهان انسان‌ها و جن و پری‌ها را نابود کند. اگر آرتمیس جلویش را نگیرد این شرور بدجنس در قدم بعدی حیات انسان‌های زمین را برای همیشه نابود خواهد کرد.

آرتمیس فاول پسر سیزده ساله ی نابغه و ماجراجو، در مدرسه ی شبانه روزی اش ایمیلی دریافت می کند. مافیای روسیه که پدر آرتمیس را ربوده، در ازای آزادی او پول هنگفتی از آرتمیس در خواست کرده است.

داستان باشکوه دوستی دو پسر به نام‌های جک و ارلی را به تصویر می‌کشد که سفری ماجراجویانه در دوران پس از جنگ جهانی دوم را آغاز می‌کنند.